Class: ODDB::AnalysisParse::TestAntibodyListParser

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Test::Unit::TestCase
  • Object
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Defined in:
ext/analysisparse/test/test_antibody_list_parser.rb

Instance Method Summary (collapse)

Instance Method Details

- (Object) setup



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# File 'ext/analysisparse/test/test_antibody_list_parser.rb', line 12

def setup
  @parser = AntibodyListParser.new
end

- (Object) test_parse_line__1



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# File 'ext/analysisparse/test/test_antibody_list_parser.rb', line 15

def test_parse_line__1
  src ="Autoantik\303\266rper gegen b2-Glykoprotein I (IgA)\n"
  begin
    result = @parser.parse_line(src)
  rescue AmbigousParseException => e
  end
  expected = {
    :description =>  'Autoantikörper gegen b2-Glykoprotein I (IgA)'
  }
  assert_equal(expected, result)
end

- (Object) test_parse_line__2



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# File 'ext/analysisparse/test/test_antibody_list_parser.rb', line 29

def test_parse_line__2
  src ="S Autoantik\303\266rper gegen CCP (Cyclisches Citrulliniertes Peptid)? Kapitel 1, Pos. 8113.20\n"
  begin
    result = @parser.parse_line(src)
  rescue AmbigousParseException => e
    puts e.inspect
  end
  expected = {
    :description =>  'Autoantikörper gegen CCP (Cyclisches Citrulliniertes Peptid)? Kapitel 1, Pos. 8113.20',
    :revision      => 'S',
  }
  assert_equal(expected, result)
end

- (Object) test_parse_page__1



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# File 'ext/analysisparse/test/test_antibody_list_parser.rb', line 45

def test_parse_page__1
  src = "4.4 Liste seltener Autoantik\303\266rper\nTarifierung: siehe Pos. 8110.00 ~V 8111.01\nRev. Bezeichnung der Antik\303\266rper\nAutoantik\303\266rper gegen b2-Glykoprotein I (IgA)\nAutoantik\303\266rper gegen b2-Glykoprotein I (IgG)\nAutoantik\303\266rper gegen b2-Glykoprotein I (IgM)\nAutoantik\303\266rper gegen 21-Hydroxylase\nAutoantik\303\266rper gegen 68 KD (hsp-70)\nAutoantik\303\266rper gegen Becherzellen\nAutoantik\303\266rper gegen BPI (IgA)\nAutoantik\303\266rper gegen BPI (IgG)\nS Autoantik\303\266rper gegen CCP (Cyclisches Citrulliniertes Peptid)? Kapitel 1, Pos. 8113.20\nAutoantik\303\266rper gegen Chondrozyten\nAutoantik\303\266rper gegen Chromatin\nAutoantik\303\266rper gegen Cytokeratin 8/18\nAutoantik\303\266rper gegen Desmoglein 1\nAutoantik\303\266rper gegen Desmoglein 3\nAutoantik\303\266rper gegen Elastase\nAutoantik\303\266rper gegen Filaggrin (Keratin)\nAutoantik\303\266rper gegen Fodrin\nAutoantik\303\266rper gegen Gangliosid GQ1B\nAutoantik\303\266rper gegen G-S-T\nAutoantik\303\266rper gegen Herzmuskel\nAutoantik\303\266rper gegen Hu, Yo, Ri\nAutoantik\303\266rper gegen IA2\nAutoantik\303\266rper gegen Kathepsin\nAutoantik\303\266rper gegen Ku\nAutoantik\303\266rper gegen Laktoferrin\nAutoantik\303\266rper gegen MAG IgM\nAutoantik\303\266rper gegen Mi 2\nAutoantik\303\266rper gegen Myelin\nAutoantik\303\266rper gegen Nukleosomen\nAutoantik\303\266rper gegen p53\nAutoantik\303\266rper gegen Parathyreoidea\nAutoantik\303\266rper gegen PM-Scl\nAutoantik\303\266rper gegen Recoverin\nAutoantik\303\266rper gegen Retina\nAutoantik\303\266rper gegen ribosomale P-Proteine\nAutoantik\303\266rper gegen Sulfatidil\n121\n"
  begin
    result = @parser.parse_page(src, 121)
  rescue AmbigousParseException => e
    puts e.inspect
  end
  expected_first = {
    :description =>  'Autoantikörper gegen b2-Glykoprotein I (IgA)'
  }
  expected_last = {
    :description =>  'Autoantikörper gegen Sulfatidil'
  }
  expected_size = 36
  assert_equal(expected_first, result.first)
  assert_equal(expected_last, result.last)
  assert_equal(expected_size, result.size)
end